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La paciente en definitiva es quien debe decidir qué forma de administración prefiere para incorporar los estrógenos que faltan a su cuerpo. La vía oral es la más común, y está especialmente indicada para aquellas con riesgos cardiovasculares. Al pasar directamente por el hígado, estimulan los efectos sobre los lípidos, que a su vez contribuyen a reducir dichos riesgos.Hay quien prefiere la aplicación de parches, por encontrarlos más naturales y cómodos. Están indicados cuando hay riesgo de trombosis o flebitis, ya que los parches tienen efecto sobre los factores de coagulación. No obstante, cuando los síntomas climatéricos son agudos, o las pacientes no cumplen la medicación prescrita, la fórmula más adecuada son las inyecciones o el implante.
Fórmulas menos experimentadas son los anillos vaginales y los geles. Los primeros se colocan en la vagina y un solo anillo es suficiente para suministrar estrógenos durante meses. Esta fórmula también se prueba actualmente como anticonceptivo. Los geles se aplican directamente sobre la piel.